| Version | 1.01 |
|---|---|
| Éditeur | Paul A. Wilson |
| Date de sortie | 25 août 2008 |
| Date ajoutée | 11 août 2004 |
| Exigences OS | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Exigences | Mac OS X 10.3 |
| Total téléchargements | 29 |
| Prix | Free |
La description
Outil de ligne de commande pour comparer des fichiers de données délimités par des virgules en utilisant des différences relatives pour déterminer les conformations les plus similaires. Compsort compare les fichiers de données en utilisant la différence relative, calcule un score de similarité, trie les scores par ordre croissant (les valeurs inférieures représentent une plus grande similarité), enregistre X nombre de scores faibles.
Les fichiers de données produits par l'utilisateur doivent être des fichiers texte délimités par des virgules. Chaque fichier représente une molécule unique. Chaque ligne d'un fichier représente une conformation unique de la molécule. La première colonne du fichier de données doit être une étiquette unique à la conformation représentée par la ligne. Le reste des colonnes sont des descripteurs numériques, tels que des mesures d'espace de distance.
Les lignes sont comparées de manière combinatoire entre les fichiers. Les étiquettes de comparaison sont concaténées et enregistrées avec les scores de l'ensemble de lignes. Cela fournit un moyen d'identifier les conformations qui ont produit un score de similarité donné.
Les travaux futurs comprennent :
ajout d'une interface graphique
publication d'un article sur mon algorithme de modélisation de pharmacophore 3D
Une version parallèle utilisant MPI
