GenoSuite

La description

GenoSuite est un cadre développé pour l'analyse protéogénomique. La stratégie basée sur FDRScore est utilisée pour intégrer les résultats de plusieurs algorithmes de recherche. L'outil protéogénomique procaryote (PPT) est développé dans le cadre du cadre GenoSuite. Le PPT sert à trouver de nouvelles traductions dans les génomes procaryotes et dépend des données protéomiques basées sur la spectrométrie de masse et de la séquence du génome associée. Les fonctionnalités incluent la configuration pour 4 algorithmes open source pour effectuer une recherche de base de données pour l'identification des peptides et toute combinaison des 4 algorithmes peut être choisie, répertorie les peptides spécifiques à la recherche de génome (nouveaux peptides), les correspondances spectrales peuvent être visualisées pour l'évaluation de la qualité, répertorie les nouvelles protéines et les changements dans les annotations de protéines existantes, et un contexte génomique visuel des nouveaux peptides peuvent également être générés.