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GATE

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Version2014
ÉditeurMount Sinai School of Medicine Ma'ayan
Date de sortieJan 21, 2014
Date ajoutéeJan 21, 2014
Exigences OSWindows 2003, Windows Vista, Windows, Windows NT, Windows Server 2008, Windows 7, Windows XP
ExigencesNone
Total téléchargements472
PrixFree

La description

GATE (Grid Analysis of Time-Series Expression) est une plate-forme logicielle de calcul intégrée pour l'analyse et la visualisation de séries chronologiques biomoléculaires de grande dimension. GATE utilise un algorithme de clustering basé sur la corrélation pour organiser des séries chronologiques moléculaires sur un réseau hexagonal bidimensionnel et colore dynamiquement les hexagones individuels en fonction du niveau d'expression du composant moléculaire auquel ils sont affectés, pour créer des films d'animation moléculaires au niveau du système. dynamique réglementaire. Afin de déduire des mécanismes de contrôle régulateurs potentiels à partir de modèles de corrélation, GATE permet également l'interrogation interactive de films par rapport à une grande variété d'ensembles de données de connaissances antérieures. Les films GATE peuvent être mis en pause et sont interactifs, permettant aux utilisateurs de reconstruire des réseaux et d'effectuer des analyses d'enrichissement fonctionnel. Les films créés avec GATE peuvent être enregistrés au format Flash et insérés directement dans des fichiers manuscrits PDF sous forme de figures interactives.