ImageSurfer

La description

ImageSurfer est un programme d'imagerie 3D gratuit pour la microcopie. Il permet aux enquêteurs de visualiser et d'analyser des volumes multi-canaux 3D et 4D (time-lapse). ImageSurfer fournit plusieurs outils de restauration d'image, y compris des algorithmes de déconvolution (filtre Wiener, itératif contraint et vraisemblance maximale) pour supprimer le flou introduit par le système d'imagerie. Pour la visualisation, ImageSurfer propose plusieurs techniques de rendu de volume et de surface. Le logiciel dispose également d'un mode isosurface coloré innovant qui fournit un affichage qualitatif de la correspondance entre deux canaux.

Un "extracteur de tranche" permet à l'utilisateur d'examiner une coupe transversale du volume pris à n'importe quelle orientation. La tranche capturée peut être visualisée comme une image 2D traditionnelle ou comme une représentation en relief 3D dans laquelle l'intensité de l'image est codée en tant que hauteur. Pour sonder davantage le chevauchement spatial entre les structures, l'enquêteur peut utiliser les données d'un autre canal pour coloriser la représentation en relief 3D. Pour la quantification, les valeurs d'intensité du signal peuvent ensuite être échantillonnées dans des tranches capturées le long d'une spline définie par l'utilisateur. En plus de prendre des instantanés de représentations 3D et de générer des films, les modèles 3D peuvent également être exportés sous forme de fichiers OBJ ou VRML (langage de modélisation de réalité virtuelle); Les fichiers VRML peuvent être visualisés dans les navigateurs Web à l'aide d'un plug-in gratuit. Les deux types de fichiers peuvent être importés dans des programmes de rendu 3D populaires pour un traitement ultérieur, et dans Acrobat 3D pour produire des documents pouvant être visualisés de manière interactive avec Adobe Reader 8.